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技術文章 / article
【連載-企業(yè)參考品】 前列腺癌的診斷參考品的選擇
原載自:www.niangtai.cn[技術資料頻道] 2020-10-15 瀏覽次數(shù):1128
科佰生物作為一家提供企業(yè)核酸診斷標準品的企業(yè),在該領域已經深耕多年,與全國該領域90%的企業(yè)都有過合作,成功支持過很多企業(yè)的試劑盒研發(fā)和獲批,在該領域有豐富的經驗。根據(jù)我們對市場的調研,對客戶需求的理解,我們把我們的產品線劃分為多個模塊,主要為支持PCR的單點mutation、fusion和CNV產品,支持NGS的小panel和大panel(泛腫瘤、包含TMB和MSI)產品,支持IHC和Fish的FFPE block產品,支持標準品定標的dPCR檢測試劑盒產品等。
接下來的幾期,我們陸續(xù)會針對不用的腫瘤,遵循NCCN指南的標注,為大家分享我們對企業(yè)參考品選擇的看法。
前列腺癌是指發(fā)生在前列腺的上皮性惡性腫瘤。2004年WHO《泌尿系統(tǒng)及男性生殖器官腫瘤病理學和遺傳學》中前列腺癌病理類型上包括腺癌(腺泡腺癌)、導管腺癌、尿路上皮癌、鱗狀細胞癌、腺鱗癌。其中前列腺腺癌占95%以上,因此,通常我們所說的前列腺癌就是指前列腺腺癌。2012年我國腫瘤登記地區(qū)前列腺癌發(fā)病率為9.92/10萬,列男性惡性腫瘤發(fā)病率的第6位。發(fā)病年齡在55歲前處于較低水平,55歲后逐漸升高,發(fā)病率隨著年齡的增長而增長,高峰年齡是70~80歲。家族遺傳型前列腺癌患者發(fā)病年齡稍早,年齡≤55歲的患者占43%。
針對前列腺癌的診斷,寫入NCCN和專家共識的主要的還是HRR(homologous recombination repair)基因的胚系和體系突變,另外還有微衛(wèi)星不穩(wěn)定性(microsatellite instability,MSI)和DNA錯配修復缺陷(DNA mismatch repair deficiency,dMMR)檢測,還有一些未明確的基因。
HRR相關基因
對于初診未進行風險評估、極低風險至中風險的前列腺癌患者,其家族史的獲得及遺傳咨詢是檢測前的必要步驟:對于具有明確相關家族史、已知家族成員攜帶胚系致病基因突變的上述風險級別患者,推薦進行DNA損傷修復相關 基因(特別是BRCA2、BRCA1、ATM、PALB2、 CHEK2、MLH1、MSH2、MSH6、PMS2)的胚系變異檢測;對于家族史不詳?shù)纳鲜鲲L險級別患者,需要結合臨床特征進行遺傳咨詢后綜合判斷 是否有必要進行相關檢測。對于高風險、*風險、局部進展及轉移性前列腺癌患者,推薦進行DNA修復基因(特別是BRCA2、BRCA1、ATM、 PALB2、CHEK2、MLH1、MSH2、MSH6、 PMS2)的胚系變異檢測。
針對HRR相關的基因,科佰生物推出多款相關的標準品:
錯配修復基因
回顧性研究發(fā)現(xiàn),錯配修復基因突變型前列腺癌患者的臨床和病理學特征更具侵襲性。國外研究報道,前列腺癌患者中dMMR及MSI-H患者 比例為2%~5%。另有研究報道,約3%的前列腺癌 患者攜帶MSH2(2%)、MLH1(1%)、MSH6(1%)及PMS2(<1%)基因體細胞變異,攜帶上述基因突變的患者往往具有很高的總體基因突變數(shù)量。在中 國316例前列腺癌患者中,攜帶MSH6、MSH2基因 胚系致病變異的患者比例均為0.63%,未發(fā)現(xiàn)攜帶 MLH1、PMS2基因胚系致病變異的患者。
《NCCN指南》推薦局部進展、轉移性及mCRPC患者進行MSI-H及dMMR檢測,如確診為MSI-H或dMMR型,mCRPC患者可在特定治療階段考慮pembrolizumab治療(2B類),同時需要進行遺傳咨詢及考慮林奇綜合征(Lynch syndrome)的相關基因檢測,進一步的MMR基因胚系變異檢測可以明確其遺傳性改變規(guī)律。
科佰基因推出多對MSI的檢測標準品:
其他基因
HOXB13基因:《費城共識》提出需要對與遺傳性前列腺癌相關的HOXB13基因進行檢測(共識 率95%),主要突變?yōu)镚84E和G135E。
RB1基因:近期多項研究發(fā)現(xiàn),RB1基因突變或缺失對mCRPC患者具有重要的預后預測價值,在mCRPC中,RB1基因突變或缺失與更差的生存期及阿比特龍或恩雜魯胺更短的治療時間有關。
AR基因:AR基因擴增/配體結構域變異(比如AR-V7)也與前列腺癌阿比特龍及恩雜魯胺敏感性降低相關。
TP53基因:TP53突變也與前列腺癌阿比特龍及恩雜魯胺敏感性降低相關。
FOXA1基因:FOXA1是與AR受體通路相關的重要基因,F(xiàn)OXA1高表達與前列腺癌的不良預后相關。近的一項對208例局限期前列腺癌患者的研究發(fā)現(xiàn),41%的中國患者攜帶FOXA1突變,遠高于既往西方發(fā)達國家患者的比例。并且中國患者FOXA1突變絕大部分為熱點突變,可能通過調節(jié)AR通路促進前列腺癌的發(fā)生、發(fā)展。
這些基因相關的標準品,我們都在開發(fā)中,歡迎咨詢…
綜上,按照NCCN的指南,按照臨床的藥物,按照伴隨診斷的需求,科佰生物開發(fā)了針對前列腺癌的各種參考品、標準品,適合不同的應用,滿足不同客戶的需求。
標準品選擇好了,接下來就是做性能評價,讓我們先學習下指導原則,對于性能評價的規(guī)定。
詳見《從《指導原則》中分析參考品盤設計》。